L’institut du thorax coordonne plusieurs centres labellisés « Maladies rares » :
- Centre de référence RythmOgen, Maladies rythmiques héréditaires , avec le Centre de prise en charge de la mort subite du sujet jeune
- Centre de référence Cardiomyopathies
- Centre de ressources et de compétences Mucoviscidose
- Centre de compétences Maladies endocriniennes rares
- Centre de compétences CEDRA, Centre d’Expertise des Dyslipidémies RAres
