L’institut du thorax coordonne 4 centres labellisés « Maladies rares » :
- Centre de référence Troubles du rythme cardiaque héréditaires ou rares de l’Ouest , avec le Centre de prise en charge de la mort subite du sujet jeune
- Centre de compétences Cardiomyopathies
- Centre de ressources et de compétences Mucoviscidose
- Centre de compétences Maladies endocriniennes rares
